Benzalkonium clorua là hút ẩm và có thể bị ảnh hưởng bởi ánh sáng, không khí và kim loại.
Các giải pháp ổn định trong phạm vi pH và nhiệt độ rộng và có thể được khử trùng bằng cách hấp thụ mà không mất hiệu quả.
Các giải pháp có thể được lưu trữ trong thời gian dài ở nhiệt độ phòng. Các dung dịch pha loãng được lưu trữ trong các thùng chứa bọt polyvinyl clorua hoặc polyurethane có thể mất hoạt tính kháng khuẩn.
Vật liệu khối nên được lưu trữ trong một thùng chứa kín, được bảo vệ khỏi ánh sáng và tiếp xúc với kim loại, ở một nơi khô ráo, mát mẻ.