Бензалконієвий хлорид є гігроскопічним і може впливати на світло, повітря та метали.
Розчини стабільні в широкому діапазоні рН та температури і можуть бути стерилізовані шляхом автоклавування без втрати ефективності.
Розчини можуть зберігатися тривалий час при кімнатній температурі. Розведені розчини, що зберігаються в полівінілхлориді або поліуретанові контейнери з піною, можуть втратити антимікробну активність.
Об'ємний матеріал повинен зберігатися в герметичній ємності, захищеній від світла та контакту з металами, в прохолодному, сухому місці.
