Hexafluórzirkoničitan sa používa hlavne pri výrobe optického skla a fluórzirkoničitanových solí.
Používa sa na povrchovú úpravu a čistenie kovov, ako aj na vlnu, kožiarsky priemysel, atómovú energiu a výrobu moderných elektromateriálov a žiaruvzdorných materiálov
Používa sa na kovové povrchy a nátery atď.