Clorura de benzalconiu este higroscopică și poate fi afectată de lumină, aer și metale.
Soluțiile sunt stabile pe un pH larg și un interval de temperatură și pot fi sterilizate prin autoclavarea fără pierderi de eficacitate.
Soluțiile pot fi păstrate pentru perioade prelungite la temperatura camerei. Soluțiile diluate depozitate în clorură de polivinil sau recipiente de spumă de poliuretan pot pierde activitatea antimicrobiană.
Materialul în vrac trebuie depozitat într -un recipient etanș, protejat de lumină și contact cu metale, într -un loc rece și uscat.
