Benzalkonium chloride adalah hygroscopic dan boleh dipengaruhi oleh cahaya, udara, dan logam.
Penyelesaian stabil di atas pH dan julat suhu yang luas dan boleh disterilkan oleh autoklaf tanpa kehilangan keberkesanan.
Penyelesaian boleh disimpan untuk tempoh yang berpanjangan pada suhu bilik. Penyelesaian cair yang disimpan dalam polivinil klorida atau bekas buih poliuretana mungkin kehilangan aktiviti antimikrob.
Bahan pukal harus disimpan dalam bekas kedap udara, dilindungi dari cahaya dan bersentuhan dengan logam, di tempat yang sejuk dan kering.
