Метансульфон қышқылы органикалық реакциялардағы катализатор ретінде қолданылады, бұл органикалық реакциялар, атап айтқанда, оның құбылмалы табиғаты мен конденсация реакциясы, органикалық еріткіштер мен ерігіштігінің арқасында конденсация реакциясы қолданылады.
Ол сонымен қатар крахмал эфирлерінің, балауыз фокоидты эфирлер, бензой қышқылы эфирлері, фенолиялық эфирлер немесе алкил эфирлерінің өндірісіне қатысады.
Бұл борға боргидридімен бірге, Боране-Тетрахидрофуран кешенін дайындау үшін полярлы еріткіштер болған.
Ол батареяда қолдануға, оның тазалығына және хлоридінің болмауына байланысты табады. Фармацевтика саласында ол Telmisartan және EProsartan сияқты белсенді фармацевтикалық ингредиенттерді өндіру үшін қолданылады.
Бұл иондық хроматографияда пайдалы және кейбір грамм-теріс метилотропикалық бактериялар үшін көміртегі мен энергия көзі пептидтерден бас тартуға қатысады.
