Бензалконий хлориді гигроскопиялық болып табылады және оған жарық, ауа және металдар әсер етуі мүмкін.
Ерітінділер кең рН және температура диапазонында тұрақты және тиімділігін жоғалтпай автоклавтау арқылы зарарсыздандырылуы мүмкін.
Ерітінділерді бөлме температурасында ұзақ уақыт сақтауға болады. Поливинилхлорид немесе көбік полиуретанды контейнерлерде сақталған сұйылтылған ерітінділер микробқа қарсы белсенділігін жоғалтуы мүмкін.
Сусымалы материалды ауа өткізбейтін контейнерде, жарықтан және металдармен жанасудан қорғалған, салқын, құрғақ жерде сақтау керек.
