ბენზალკონიუმის ქლორიდი ჰიგიროსკოპიულია და შეიძლება გავლენა იქონიოს სინათლეზე, ჰაერზე და ლითონებზე.
ხსნარები სტაბილურია pH-ისა და ტემპერატურის ფართო დიაპაზონში და შეიძლება სტერილიზაცია მოხდეს ავტოკლავირებით ეფექტურობის დაკარგვის გარეშე.
ხსნარები შეიძლება დიდხანს ინახებოდეს ოთახის ტემპერატურაზე. პოლივინილქლორიდის ან პოლიურეთანის ქაფის კონტეინერებში შენახულმა განზავებულმა ხსნარებმა შეიძლება დაკარგოს ანტიმიკრობული მოქმედება.
ნაყარი მასალა უნდა ინახებოდეს ჰერმეტულ კონტეინერში, სინათლისაგან და ლითონებთან კონტაქტისგან დაცულ, გრილ, მშრალ ადგილას.