Բենզալկոնիումի քլորիդը հիգրոսկոպիկ է և կարող է ազդել լույսի, օդի և մետաղների ազդեցության տակ:
Լուծումները կայուն են pH-ի և ջերմաստիճանի լայն տիրույթում և կարող են ստերիլիզացվել ավտոկլավացման միջոցով՝ առանց արդյունավետության կորստի:
Լուծույթները կարող են երկար ժամանակ պահել սենյակային ջերմաստիճանում: Պոլիվինիլքլորիդով կամ պոլիուրեթանային փրփուրով տարաներում պահվող նոսր լուծույթները կարող են կորցնել հակամանրէային ակտիվությունը:
Հիմնական նյութը պետք է պահվի հերմետիկ տարայի մեջ, պաշտպանված լույսից և մետաղների հետ շփվելուց, զով, չոր տեղում:
