A benzalkonium -klorid higroszkópos, és a fény, a levegő és a fémek befolyásolhatják.
Az oldatok széles pH és hőmérsékleti tartományban stabilak, és a hatékonyság elvesztése nélkül sterilizálhatók autoklávozással.
Az oldatokat hosszabb ideig szobahőmérsékleten lehet tárolni. A polivinil -kloridban vagy poliuretán habtartókban tárolt híg oldatok elveszíthetik az antimikrobiális aktivitást.
Az ömlesztett anyagot légmentesen lezárt tartályban kell tárolni, védve a fénytől és a fémekkel való érintkezéshez, hűvös, száraz helyen.