Heksafluorocirkonat se uglavnom koristi u proizvodnji optičkog stakla i fluorocirkonatnih soli.
Koristi se za obradu i čišćenje metalnih površina, kao i za industriju vune, kože, industriju atomske energije i proizvodnju naprednih elektromaterijala i vatrostalnih materijala.
Koristi se za metalne površine i premaze, itd.