बेंजालकोनियम क्लोराइड हीड्रोस्कोपिक है और प्रकाश, वायु और धातुओं से प्रभावित हो सकता है।
समाधान एक विस्तृत पीएच और तापमान सीमा पर स्थिर होते हैं और प्रभावशीलता के नुकसान के बिना ऑटोक्लेविंग द्वारा निष्फल किए जा सकते हैं।
समाधानों को कमरे के तापमान पर लंबे समय तक संग्रहीत किया जा सकता है। पॉलीविनाइल क्लोराइड या पॉलीयूरेथेन फोम कंटेनर में संग्रहीत पतला समाधान रोगाणुरोधी गतिविधि खो सकता है।
थोक सामग्री को एक एयरटाइट कंटेनर में, प्रकाश और धातुओं के संपर्क से सुरक्षित, ठंडी, सूखी जगह पर संग्रहित किया जाना चाहिए।