Metaansulfonzuur wurdt brûkt as katalysator yn organyske reaksjes, nammentlik esterifikaasje, alkylaasje en kondensaasjereaksjes fanwegen syn net-flechtich aard en oplosberens yn organyske solvents.
It is ek belutsen by de produksje fan setmoalesters, waxoxidatesters, benzoic acid esters, fenolyske esters, as alkylesters.
It reageart mei natriumborohydride yn oanwêzigens fan polar solvent tetrahydrofuran om borane-tetrahydrofuran-kompleks te meitsjen.
It fynt tapassing yn batterijen, fanwege syn suverens en chloride ôfwêzigens. Yn 'e farmaseutyske yndustry wurdt it brûkt foar it meitsjen fan aktive farmaseutyske yngrediïnten lykas telmisartan en eprosartan.
It is brûkber yn ion chromatography en is in boarne fan koalstof en enerzjy foar guon gram-negative methylotropic baktearjes.It is belutsen by de deprotection fan peptiden.