Heksafluorosirkonaattia käytetään pääasiassa optisen lasin ja fluorosirkonaattisuolojen valmistuksessa.
Käytetään metallien pintakäsittelyyn ja puhdistukseen, sekä villa-, nahka-, atomienergiateollisuuteen sekä kehittyneiden sähkömateriaalien ja tulenkestävän materiaalin tuotantoon
Käytetään metallipinnoille ja pinnoitteille jne.