Bensalkooniumkloriid on hügroskoopne ja seda võivad mõjutada valgus, õhk ja metallid.
Lahused on stabiilsed laias pH- ja temperatuurivahemikus ning neid saab steriliseerida autoklaaviga, ilma et nende efektiivsus väheneks.
Lahuseid võib toatemperatuuril pikka aega säilitada. Polüvinüülkloriidist või polüuretaanvahust anumates hoitavad lahjendatud lahused võivad kaotada antimikroobse toime.
Puistematerjali tuleb hoida õhukindlas konteineris, kaitstuna valguse ja metallidega kokkupuute eest, jahedas ja kuivas kohas.
