1. Estable bajo temperatura y presión normales.
Materiales incompatibles: álcali, agente oxidante, agente reductor.
2. Baja toxicidad. Tiene un efecto estimulante sobre la piel y las mucosas, pero no es tan grave como el ácido oxálico. La LD50 oral para ratones es de 1,54 g/kg. Generalmente no se necesita protección especial al producir ácido malónico, pero el ácido cianoacético y el cianuro de sodio son venenos potentes, por lo que se debe tener especial cuidado al manipular compuestos que contienen grupos ciano, usar equipo antivirus y desarrollar las medidas de seguridad correspondientes.
3. Existe en hojas de tabaco curadas al humo, hojas de tabaco burley y humo convencional.
4. Se puede sublimar al vacío.