Benzalkonium-klorido estas higroskopa kaj povas esti tuŝita de lumo, aero kaj metaloj.
Solvoj estas stabilaj en larĝa pH kaj temperaturintervalo kaj povas esti steriligitaj per aŭtoklavo sen perdo de efikeco.
Solvoj povas esti stokitaj por longedaŭraj periodoj ĉe ĉambra temperaturo. Diluitaj solvoj stokitaj en polivinilklorido aŭ poliuretana ŝaŭmo ujoj povas perdi antimikroban agadon.
La pogranda materialo devas esti stokita en hermetika ujo, protektita kontraŭ lumo kaj kontakto kun metaloj, en malvarmeta, seka loko.