Mae clorid benzalkonium yn hygrosgopig a gall golau, aer a metelau effeithio arno.
Mae hydoddiannau'n sefydlog dros ystod pH a thymheredd eang a gellir eu sterileiddio trwy awtoclafio heb golli effeithiolrwydd.
Gellir storio toddiannau am gyfnodau hir ar dymheredd ystafell. Gall hydoddiannau gwanedig sy'n cael eu storio mewn cynwysyddion ewyn polyvinyl clorid neu polywrethan golli gweithgaredd gwrthficrobaidd.
Dylid storio'r deunydd swmp mewn cynhwysydd aerglos, wedi'i ddiogelu rhag golau a chyswllt â metelau, mewn lle oer, sych.