Hexafluorozirkoničitan se používá hlavně při výrobě optického skla a fluorozirkoničitanových solí.
Používá se pro povrchovou úpravu a čištění kovů, dále pro vlnu, kožedělný průmysl, průmysl atomové energie a výrobu pokročilých elektromateriálů a žáruvzdorných materiálů
Používá se na kovové povrchy a nátěry atd.