Бензалконія хларыд гіграскапічны і можа падвяргацца ўздзеянню святла, паветра і металаў.
Растворы стабільныя ў шырокім дыяпазоне pH і тэмператур і могуць быць стэрылізаваны ў аўтаклаве без страты эфектыўнасці.
Растворы могуць захоўвацца працяглы час пры пакаёвай тэмпературы. Разведзеныя растворы, якія захоўваюцца ў ёмістасцях з полівінілхларыду або пенаполіурэтану, могуць страціць антымікробную актыўнасць.
Сыпкі матэрыял трэба захоўваць у герметычным кантэйнеры, абароненым ад святла і кантакту з металамі, у прахалодным, сухім месцы.
