Benzalkonium xlorid hiqroskopikdir və yüngül, hava və metallardan təsirlənə bilər.
Həlllər geniş bir pH və temperatur aralığında sabitdir və effektivliyini itirmədən avtoklaviya ilə sterilizasiya edilə bilər.
Həll yolları otaq temperaturunda uzun müddətə saxlanıla bilər. Polyvinil xloriddə və ya poliuretan köpük qablarında saxlanan həlləri seyreltilmiş həllər antimikrobiyal fəaliyyətini itirə bilər.
Toplu material bir hava keçirməyən bir konteynerdə saxlanılmalı, işıqdan qorunmalı və metallarla, sərin, quru yerdə.