يستخدم حمض الميثانيسلفونيك كمحفز في التفاعلات العضوية وهي تفاعلات الألكلة والتكثيف بسبب طبيعتها غير المتطايرة والذوبان في المذيبات العضوية.
وتشارك أيضًا في إنتاج استرات النشا ، أو استرات أكسدة الشمع ، أو استرات حمض البنزويك ، أو استرات الفينول ، أو استرات الألكيل.
يتفاعل مع بوروهيدريد الصوديوم في وجود رباعي هيدروفوران المذيبات القطبية لإعداد مجمع بورين توتراهيدروفوران.
يجد التطبيق في البطاريات ، بسبب نقاءها وغياب كلوريد. في صناعة الأدوية ، يتم استخدامه لتصنيع المكونات الصيدلانية النشطة مثل Telmisartan و Eprosartan.
إنه مفيد في كروماتوجرافيا الأيونات وهو مصدر للكربون والطاقة لبعض البكتيريا الميثيلوتراوبية السلبية للجرام. وتشارك في إزالة الببتيدات.