Methanesulfonic acid word gebruik as 'n katalisator in organiese reaksies, naamlik verestering, alkilering en kondensasie-reaksies as gevolg van die nie-vlugtige aard en oplosbaarheid daarvan in organiese oplosmiddels.
Dit is ook betrokke by die produksie van styselesters, wasoksidaatesters, bensoësuuresters, fenoliese esters of alkielesters.
Dit reageer met natriumborhidried in teenwoordigheid van polêre oplosmiddel tetrahydrofuran om boraan-tetrahydrofuran-kompleks voor te berei.
Dit vind toediening in batterye, vanweë die suiwerheid en afwesigheid van chloried. In die farmaseutiese industrie word dit gebruik vir die vervaardiging van aktiewe farmaseutiese bestanddele soos Telmisartan en Eprosartan.
Dit is nuttig in ioonchromatografie en is 'n bron van koolstof en energie vir sommige Gram-negatiewe metielotropiese bakterieë. Dit is betrokke by die onderdrukking van peptiede.
